Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
EEA1Q15075 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
EEA1Q15075 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
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