Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MitfQ08874 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms