Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RhoP15409 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RhoP15409 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RhoP15409 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RhoP15409 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RhoP15409 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 824.5 ms