Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prf1P10820 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prf1P10820 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms