Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms