Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPRTO14522 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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PTPRTO14522 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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PTPRTO14522 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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PTPRTO14522 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTPRTO14522 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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