Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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PTPN13Q12923 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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PTPN13Q12923 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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PTPN13Q12923 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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PTPN13Q12923 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPN13Q12923 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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