Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MitfQ08874 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MitfQ08874 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms