Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms