Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gps1Q99LD4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms