Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms