Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms