Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPRTO14522 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.2 ms