Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gpc1Q9QZF2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gpc1Q9QZF2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gpc1Q9QZF2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpc1Q9QZF2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gpc1Q9QZF2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms