Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gps1Q99LD4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms