Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnga1P29974 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms