Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SardhQ99LB7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms