Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sdr16c6Q05A13 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sdr16c6Q05A13 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms