Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kif3aP28741 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kif3aP28741 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms