Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RhoP15409 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RhoP15409 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RhoP15409 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RhoP15409 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms