Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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PRKCHP24723 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PRKCHP24723 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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PRKCHP24723 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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PRKCHP24723 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PRKCHP24723 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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