Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gps1Q99LD4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms