Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnga1P29974 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms