Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb3P09026 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb3P09026 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms