Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Zcchc8Q9CYA6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc8Q9CYA6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms