Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
NipblQ6KCD5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms