Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms