Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sdr16c6Q05A13 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms