Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms