Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Subh2bvQ9D9Z7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms