Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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