Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Arcn1Q5XJY5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Arcn1Q5XJY5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Arcn1Q5XJY5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Arcn1Q5XJY5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Arcn1Q5XJY5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Arcn1Q5XJY5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Arcn1Q5XJY5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Arcn1Q5XJY5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Arcn1Q5XJY5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Arcn1Q5XJY5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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Arcn1Q5XJY5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Arcn1Q5XJY5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms