Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5cP41230 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5cP41230 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms