Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbip1J3QMK2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms