Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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Gm4491E0CX42 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Gm4491E0CX42 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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