Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col9a3A2ACT7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms