Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Arcn1Q5XJY5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arcn1Q5XJY5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms