Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms