Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bbip1J3QMK2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbip1J3QMK2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.3 ms