Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms