Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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