Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
NipblQ6KCD5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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