Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB02

Nfkbid, NF-kappa-B inhibitor delta, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbidQ2TB02 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NfkbidQ2TB02 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfkbidQ2TB02 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms