Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pfdn6Q03958 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms