Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Epb41P48193 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms