Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms