Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrit3W8DXL4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrit3W8DXL4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrit3W8DXL4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrit3W8DXL4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrit3W8DXL4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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