Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn2r25W4VSP2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn2r25W4VSP2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r25W4VSP2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn2r25W4VSP2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r25W4VSP2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms