Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PdfS4R2K0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PdfS4R2K0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdfS4R2K0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdfS4R2K0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms