Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Upk1bQ9Z2C6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Upk1bQ9Z2C6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Upk1bQ9Z2C6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Upk1bQ9Z2C6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Upk1bQ9Z2C6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms